Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L2Q15782 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L2Q15782 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms