Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRADDQ15628 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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