Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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