Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNPS1Q15287 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNPS1Q15287 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNPS1Q15287 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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