Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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RABEP1Q15276 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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RABEP1Q15276 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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RABEP1Q15276 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP1Q15276 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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RABEP1Q15276 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
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