Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLCA4Q14CN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA4Q14CN2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA4Q14CN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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