Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSME4Q14997 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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