Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARF1Q14162 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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