Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL9A3Q14050 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
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