Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEUROD1Q13562 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
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