Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms