Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MTM1Q13496 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTM1Q13496 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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