Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA1Q13136 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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