Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP4Q13115 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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