Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC16Q13042 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC16Q13042 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC16Q13042 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC16Q13042 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC16Q13042 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC16Q13042 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC16Q13042 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC16Q13042 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC16Q13042 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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