Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK3Q13003 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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