Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF2Q12947 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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