Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COX10Q12887 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COX10Q12887 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COX10Q12887 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COX10Q12887 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COX10Q12887 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COX10Q12887 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COX10Q12887 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COX10Q12887 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX10Q12887 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX10Q12887 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms