Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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