Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF5Q12774 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF5Q12774 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARHGEF5Q12774 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF5Q12774 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
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