Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 Q0144Q0144 330 nt5.29□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 ROT1YMR200W 771 nt5.29□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 YMR295CYMR295C 594 nt5.29□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 MRPL37YBR268W 318 nt5.29□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 BUD8YLR353W 1812 nt5.29□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 RGP1YDR137W 1992 nt5.29□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 TPS3YMR261C 3165 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 TUB3YML124C 1338 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 HES1YOR237W 1305 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 SHR3YDL212W 633 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 YDL218WYDL218W 954 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 BUD26YDR241W 288 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 TFB3YDR460W 966 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 KEG1YFR042W 603 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 SEN34YAR008W 828 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 HAP3YBL021C 435 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 TPP1YMR156C 717 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 YNL285WYNL285W 372 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 ATG29YPL166W 642 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 MDM31YHR194W 1740 nt5.28□□□□□ -1.56
NOP56Q12460 PAN5YHR063C 1140 nt5.27□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.27□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SAW1YAL027W 786 nt5.27□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YKR041WYKR041W 753 nt5.27□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 GRX1YCL035C 333 nt5.27□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 THI20YOL055C 1656 nt5.27□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 BIT2YBR270C 1638 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 LDB17YDL146W 1476 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 ERG4YGL012W 1422 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 GLE2YER107C 1098 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 MPS2YGL075C 1164 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 DCD1YHR144C 939 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YMR084WYMR084W 789 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 GGA1YDR358W 1674 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 MDM10YAL010C 1482 nt5.26□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 DNF2YDR093W 4839 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 MDR1YGR100W 2853 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 DSF1YEL070W 1509 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YNR073CYNR073C 1509 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 RPC53YDL150W 1269 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YER010CYER010C 705 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 CAB4YGR277C 918 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SFC1YJR095W 969 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 GMH1YKR030W 822 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 RNH201YNL072W 924 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 PDX3YBR035C 687 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SMA1YPL027W 738 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YPR098CYPR098C 486 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 QDR3YBR043C 2070 nt5.25□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 MGR3YMR115W 1506 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SSZ1YHR064C 1617 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 DDI2YFL061W 678 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 LEU5YHR002W 1074 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 AIM23YJL131C 1071 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SSU72YNL222W 621 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 DDI3YNL335W 678 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 GLO4YOR040W 858 nt5.24□□□□□ -1.57 RIP-Chip
NOP56Q12460 snR19snR19 568 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 FBP26YJL155C 1359 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 ATG4YNL223W 1485 nt5.24□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 TPO2YGR138C 1845 nt5.23□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YDL124WYDL124W 939 nt5.23□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 RPF2YKR081C 1035 nt5.23□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 ATG16YMR159C 453 nt5.23□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YBR219CYBR219C 384 nt5.23□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 RAD24YER173W 1980 nt5.23□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 OCT1YKL134C 2319 nt5.23□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YMR196WYMR196W 3267 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 MRPS35YGR165W 1038 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 LNP1YHR192W 837 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 SYN8YAL014C 768 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 CDC73YLR418C 1182 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 YLR463CYLR463C 552 nt5.22□□□□□ -1.57 RIP-Chip
NOP56Q12460 YML018CYML018C 1182 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 DCI1YOR180C 816 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 GDE1YPL110C 3672 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 ALG2YGL065C 1512 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 HIR2YOR038C 2628 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 TFC7YOR110W 1308 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 LEU1YGL009C 2340 nt5.22□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 FOL1YNL256W 2475 nt5.21□□□□□ -1.57
NOP56Q12460 MSS2YDL107W 1056 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 YHB1YGR234W 1200 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 YHL018WYHL018W 363 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 ARG3YJL088W 1017 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 TTI2YJR136C 1266 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 YLR118CYLR118C 684 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 IAH1YOR126C 717 nt5.21□□□□□ -1.58
NOP56Q12460 YLR345WYLR345W 1530 nt5.21□□□□□ -1.58
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