Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CPSF1Q10570 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CPSF1Q10570 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
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