Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUDPQ08623 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.7 ms