Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP1Q07960 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP1Q07960 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms