Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPARAQ07869 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms