Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX8Q06710 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms