Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPB1Q06547 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms