Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
REG3AQ06141 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REG3AQ06141 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms