Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms