Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN1Q04323 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms