Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F1Q03052 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F1Q03052 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms