Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLH2Q02577 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms