Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC1Q01954 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms