Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKB2Q00653 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms