Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42EP1Q00587 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms