Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK3Q00526 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms