Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKOR1P84550 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKOR1P84550 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKOR1P84550 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms