Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP5P82980 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP5P82980 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP5P82980 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP5P82980 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP5P82980 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP5P82980 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP5P82980 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP5P82980 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP5P82980 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP5P82980 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP5P82980 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP5P82980 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP5P82980 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP5P82980 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP5P82980 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP5P82980 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP5P82980 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP5P82980 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP5P82980 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBP5P82980 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP5P82980 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP5P82980 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP5P82980 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP5P82980 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP5P82980 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms