Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL8P80075 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL8P80075 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL8P80075 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL8P80075 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL8P80075 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL8P80075 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL8P80075 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL8P80075 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL8P80075 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL8P80075 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL8P80075 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL8P80075 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL8P80075 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL8P80075 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL8P80075 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL8P80075 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL8P80075 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL8P80075 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL8P80075 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL8P80075 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL8P80075 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms