Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC5P78333 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC5P78333 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC5P78333 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC5P78333 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC5P78333 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC5P78333 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC5P78333 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC5P78333 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC5P78333 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC5P78333 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC5P78333 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC5P78333 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC5P78333 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC5P78333 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC5P78333 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC5P78333 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC5P78333 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC5P78333 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC5P78333 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC5P78333 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC5P78333 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC5P78333 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC5P78333 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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