Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms