Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTC1P68032 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms