Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms