Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P63132 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms