Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4XP62701 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms