Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPFP62306 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms