Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS16P62249 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS16P62249 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS16P62249 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPS16P62249 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS16P62249 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS16P62249 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS16P62249 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS16P62249 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS16P62249 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms