Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTENP60484 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTENP60484 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTENP60484 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTENP60484 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTENP60484 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTENP60484 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTENP60484 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTENP60484 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTENP60484 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTENP60484 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTENP60484 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTENP60484 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTENP60484 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTENP60484 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTENP60484 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTENP60484 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTENP60484 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTENP60484 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTENP60484 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTENP60484 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTENP60484 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTENP60484 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTENP60484 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTENP60484 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTENP60484 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms