Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB15P59190 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB15P59190 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB15P59190 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB15P59190 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB15P59190 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB15P59190 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB15P59190 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB15P59190 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB15P59190 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB15P59190 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB15P59190 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB15P59190 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB15P59190 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB15P59190 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB15P59190 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB15P59190 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms