Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VSX2P58304 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSX2P58304 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSX2P58304 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSX2P58304 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSX2P58304 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSX2P58304 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VSX2P58304 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSX2P58304 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSX2P58304 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSX2P58304 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSX2P58304 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSX2P58304 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VSX2P58304 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSX2P58304 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSX2P58304 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSX2P58304 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSX2P58304 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSX2P58304 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSX2P58304 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VSX2P58304 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VSX2P58304 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VSX2P58304 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSX2P58304 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSX2P58304 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSX2P58304 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSX2P58304 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSX2P58304 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VSX2P58304 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSX2P58304 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSX2P58304 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms